解像度と関係する高画質の話だと2つのケースがあります。
動きが激しい映像、FPSを高く設定している場合は解像度を下げたほうが高画質になります。とはいえ拡大処理の関係もあるために512x288などがいいかと思います。
静止画などをきれいに見せる場合でも、640x360程度がニコニコ生放送での画質では十分なものになります。
ゲームの解像度が1920x1080や1024x768だからといって配信の解像度も揃える必要はありません。
FPSや解像度はテスト配信を繰り返し、自分の配信内容に合ったものを探すのが一番いいかと思います。
比較に使った画像(JPEG 3,159kb)
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またニコニコ生放送の仕様変更、パソコンの性能によって記載と異なる場合があります。( 2012/11/2 )